用過太陽能熱水器的人可能會發現如下問題：
1. 水質不新鮮，水箱中的水不能一次性用完，下次用水即是剩水，可能存在亞硝酸鹽及治病菌團。
2. 壓力不夠，水流量小，不能充分享受淋浴的快感。
3. 真空管和水箱結垢，清洗非常麻煩。
4. 管道保溫效果不好，熱量損失多，尤其在冬天，管路容易被凍壞。
