機房精密空調一般配置的空氣過濾器為可清洗式鋁合金框架板式過濾器，一級防火濾芯，過濾等級為G4即美國ASHRAE52-76標準中的G4級或Eurovent4-5標準的EU4級，阻塵值90％(具體可以參考空氣過濾器分級標準)，配置過濾器堵塞、低氣流保護開關。
1．傳統的舒適性空調主要是針對于人員設計，送風量小，送風焓差大，降溫和除濕同時進行；而機房內顯熱量占全部熱量的90％以上，它包括設備本身發熱、照明發熱量、通過墻壁、天花、窗戶、地板的導熱量，以及陽光輻射熱，通過縫隙的滲透風和新風熱量等。這些發熱量產生的濕量很小，因此采用舒適性空調勢必造成機房內相對濕度過低，而使設備內部電路元器件表面積累靜電，產生放電損壞設備，干擾數據傳輸和存儲。同時，由于制冷量的（40％～60％）消耗在除濕上，使得實際冷卻設備的冷量減少很多，大大增加了能量的消耗。機房專用空調在設計上采用嚴格控制蒸發器內蒸發壓力，增大送風量使蒸發器表面溫度高于空氣露點溫度而不除濕，產生的冷量全部用來降溫，提高了工作效率，降低了濕量損失，即由于送風量大，送風焓差減小。
2．舒適性空調風量小，風速低，只能在送風方向局部氣流循環，不能在機房形成整體的氣流循環，機房冷卻不均勻，使得機房內存在區域溫差，送風方向區域溫度低，其他區域溫度高，發熱設備因擺放位置不同而產生局部熱量積累，導致設備過熱損壞。而機房專用空調送風量大，機房換氣次數高（通常在30～60次／小時），整個機房內能形成整體的氣流循環，使機房內的所有設備均能平均得到冷卻。
3．傳統的舒適性空調，由于送風量小，換氣次數少，機房內空氣不能保證有足夠高的流速將塵埃帶回到過濾器上，而在機房設備內部產生沉積，對設備本身產生不良影響。且一般舒適性空調機組的過濾性能較差，不能滿足計算機的凈化要求。采用機房專用空調送風量大，空氣循環好，同時因具有專用的空氣過濾器，能及時高效的濾掉空氣中的塵挨，保持機房的潔凈度。
4．因大多數機房內的電子設備均是連續運行的，工作時間長，因此要求機房專用空調在設計上可大負荷常年連續運轉，并要保持極高的可靠性。舒適性空調較難滿足要求，尤其是在冬季，計算機機房因其密封性好而發熱設備又多，仍需空調機組正常制冷工作，此時，一般舒適性空調由于室外冷凝壓力過低已很難正常工作，機房專用空調通過可控的室外冷凝器，仍能正常保證制冷循環工作。
5．機房空調一般還配備了專用加濕系統，高效率的除濕系統及電加熱補償系統，通過微處理器，根據各傳感器返饋回來的數據能夠精確的控制機房內的溫度和濕度，而舒適性空調一般不配備加濕系統，只能控制溫度且精度較低，濕度則較難控制，不能滿足機房設備的需要。
綜上所述，機房空調與舒適型空調在產品設計方面存在顯著差別，二者為不同得目的而設計，無法互換使用。計算機機房內必須使用機房專用空調。目前，國內許多行業，如金融、郵電通信、電視臺、石油勘探、印刷、科研、電力等已經廣泛采用，提高了機房內計算機、網絡、通信系統的可靠性和運行的經濟型。
以上機房空調和普通空調的五大區別，機機房對溫度、濕度及潔凈度均有較嚴格的要求，因此，計算機機房專用空調在設計上與傳統的舒適性空調有著很大的不同。
機房精密空調配置的空氣過濾器和一般的中央空調上的初效空氣過濾器其實差別并不是太大.
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