利用特色資源，發展專用領域分析儀器及系統。我國在工農業生產、環境保護和食品安全等領域用的科學儀器有一定研發基礎。同時，工業企業生產用科學儀器需要提供現場服務，但跨國公司提供現場服務的大多是代理公司，因此，跨國公司難以得到價值鏈的全部利潤，這些給我國儀器生產企業提供了機遇。我國科學儀器產業可重點發展上述領域的專用分析儀器，包括農產品和食品營養成分檢測、農藥及殘留檢測、土壤速測等農業和食品專用儀器，環境監測儀、生命科學儀器、煤礦安全檢測儀等。
發展有一定研發基礎的高檔科學儀器產品。“十五”“十一五”期間，國家科技計劃支持了一批高檔科學儀器的研發，有些項目已經開始產業化。“十三五”期間，建議將這些項目作為產業化支持的重點。依據目前我國的工業基礎，還難以制造出具有競爭力的高端質譜儀，但并不是所有使用質譜儀的領域都要求很高的靈敏度和分辨率。在一些特定領域，對于在線、快速、專屬性的要求勝過對其他指標的要求，生產這樣的專用質譜儀器，不僅可以滿足用戶的需求，還可以避免與跨國公司直接競爭。
加強通用分析儀器關鍵技術和關鍵部件研發，增強產品的可靠性和穩定性。關鍵技術和關鍵部件落后，是我國科學儀器設備總體水平落后于發達國家的主要因素。我國在光譜儀器、色譜儀器的關鍵部件研發方面具有一定基礎，尤其是光譜類儀器起步早，國產化程度相對較好，并且有相當一部分儀器出口到海外，但是在可靠性和穩定性方面還需要進一步提高。建議加強這兩類通用分析儀器關鍵技術和關鍵部件的研發，增強其穩定性和可靠性，并建立儀器應用評價的數據庫。
研發高檔科學儀器的關鍵零部件。多數高檔科學儀器產品的國內需求量很少，比如大型串級高精度高靈敏度質譜儀、高倍數電子顯微鏡、高頻率核磁等，目前主要依靠進口，可以滿足需求。在整機技術攻關時機不成熟的條件下，建議投入經費研制高檔科學儀器產品所必需的關鍵部件，等待時機再研發整機。
加強專用科學儀器應用標準的研發。隨著科技不斷進步和計算機技術的發展，大量新材料、新技術、新方法涌入分析儀器產品設計應用之中。一些專用儀器和民生儀器也從傳統儀器中脫穎而出，如食品檢測儀器、石油產品檢測儀器等，這些科學儀器的標準均需要明確和完善。
加快發展科學儀器制造服務業，加強應用技術研究。科學儀器制造服務業包括：為用戶提供針對市場需求的技術解決方案，提供軟件服務，提供科學儀器產品的配套零部件、耗材等。針對這些領域，建議加強應用實驗室建設，加快應用技術研究，建立完善的銷售服務體系，增強科學儀器產品的附加價值，增強企業的競爭力。