很多用戶購買了冷藏車，便在使用上都只懂運輸環節，很多技巧性的問題都不是很清楚冷藏車使用時將溫控器設定在所需溫度上，預冷車箱1.5小時以排走滯留在車箱內的熱量；裝貨時將冷凍機組關閉，迅速裝貨。
在裝貨時，必須先要對車廂進行預冷或預熱。因為車輛停放在露天，通常車廂溫度就是外界環境溫度。若所運送的貨物溫度不是環境溫度，貨物裝進車廂，環境溫度會影響運送貨物的溫度，從而導致運送貨物的品質發生變化。因此裝貨前必須預冷車廂到所需要的溫度。但是，在裝貨時（卸貨一樣）必須要關閉制冷機組。許多人在裝卸貨物時都是不關閉制冷機組，其實這是一種非常錯誤的操作。
原因是：當我們把車廂預冷后，如果不關機，打開車廂門時，由于冷凍機組蒸發器的風扇是在工作，風扇的正面是正壓，而其背面是負壓，因此冷氣從車廂上部吹出，而下部會將外面的熱空氣快速吸進來，從而導致車廂內的溫度快速上升；如果關機后再裝卸貨物，由于風機處于停止狀態，空氣流動停止，車廂內外風壓一致，因而使得外部熱空氣傳遞進入車廂內的速度相對減緩。
貨物必須預冷到所需的溫度，裝貨時檢查貨物溫度；冷凍機組是用來保持貨物的溫度，而非用以降低貨物溫度的。
許多冷藏車的使用者都有一個錯誤的概念，總認為冷藏車上的冷凍機組是可以隨意將裝入車廂內的貨物冷凍或加熱至其所需要的溫度。因此把不足所運輸溫度要求的貨物裝入車廂，再將制冷機組設定到其所需要的運輸溫度，通過一定時間將貨物溫度降至或升至其所需要的溫度。然而事實卻相反，貨物不但溫度降不下來（或升不上去），反而使貨物損壞或變質。因為冷藏車的制冷機組不是降低貨物溫度的，而是維持貨物溫度的，他就象我們過去賣冷飲時用的棉被，將貨物包起來。當外界的冷（熱）源通過輻射、傳導、對流到廂體內，被制冷機組吹出的冷氣帶走，隔絕熱源進入貨物。
因此在裝貨時，必須先測量所裝貨物的溫度。如果制冷機組的設定點溫度高于或低于貨物溫度，車廂內的貨物溫度都很難達到運輸所需要的溫度。貨物的儲存溫度與運輸溫度必須一致，如果貨物溫度經常變化，水分就會流失，就會導致貨物發生品質變化，從而導致貨物的貨架期縮短。