當含有這些的水流經冷卻器表面時，容易形成污垢沉積物，形成垢下腐蝕，為某些**生存和繁殖提供溫床。當防腐措施不當時，換熱表面腐蝕穿孔而泄漏。
2.生物污垢
除海水冷卻裝置外，一般生物污垢均指微生物污垢。循環水中常見的微生物主要是鐵**、**和藻類。
鐵**能把溶于水中的Fe2+ 轉化為不溶于水的Fe2O3 的水合物，在水中產生大量鐵氧化物沉淀以及建立氧濃差腐蝕電池，腐蝕金屬。
且循環水中的藻類常在水中形成金屬表面差異腐蝕電池而沉積物下腐蝕。塊狀的還會堵塞冷卻器中的管路，水的流量，從而換熱效率。
3.結晶污垢
在冷卻水循環中，隨著水分的蒸發，水中溶解的鹽類（如重碳酸鹽）的濃度，部分鹽類因過飽和而析出，而某些鹽類則因通過冷卻器傳熱表面時受熱分解產生沉淀。這些水垢由無機鹽組成、結晶致密，被稱為結晶水垢。
4.腐蝕污垢
具有腐蝕性的流體或者流體中含有腐蝕性的雜質對換熱表面腐蝕而產生的污垢。腐蝕程度取決于流體中的成分、溫度及被處理流體的 pH 值等因素。
通常，冷卻管中的污垢冷卻管一般為紫銅管和黃銅管，金屬腐蝕主要是較高溫度下(40～50℃)的氧腐蝕，污垢以銅或銅合金腐蝕產物和鈣鎂沉淀物為主，從而造成大量腐蝕污垢。
5.凝固污垢
流體在過冷的換熱面上凝固而形成的污垢。例如當水低于冰點而在換熱表面上凝固成冰。溫度分布的均勻與否對這種污垢影響很大。
金屬腐蝕
冷卻器大多數是金屬質地，而在自然界中大多數金屬常以礦石的形式，即金屬化合物的形式存在，而腐蝕則是一種金屬回復到自然狀態的。
冷卻器的腐蝕主要是指板片的腐蝕。與水質不純、大氣對水的污染、管面狀況以及水流速大小等因素均有著密切關系。